قامت فكرة المنظمة على تخليد ذكرى المرحومة ( أفراح خليفة محمد أحمد ) وذلك فى العام 2014 م , بداية اخذت مسمى مشروع أفراح الخيري ، وفي العام 2016 م تم تسجيل المنظمة بمفوضية العون الانساني شمال كرفان واخذت اسم منظمة أفراح الخيرية .